Окончила с красным дипломом лечебный факультет Северо-Западного государственного медицинского университета, где на протяжении шести лет изучала фундаментальные и клинические дисциплины. По окончании медицинского университета Светлана Афанасьевна была рекомендована к зачислению в клиническую ординатуру по специальности «Терапия», после которой она прошла первичную переподготовку по специальности «кардиология». После ординатуры она поступила в аспирантуру, где продолжила углубленное изучение кардиологии, а через три года успешно выступила на защите своей кандидатской диссертации. В дальнейшем Светлана Афанасьевна начала совмещать работу в практической медицине с работой на кафедре факультетской терапии СЗГМУ. Здесь она прошла путь от ассистента кафедры до профессора, успешно защитила докторскую диссертацию. На данный момент заведует кафедрой, входит в рабочую группу Европейского общества кардиологов и продолжает активно заниматься клинической медициной. Болдуева Светлана Афанасьевна консультирует пациентов с различными сердечно-сосудистыми заболеваниями, а также занимается проблемой реабилитации пациентов с тяжелыми заболеваниями сердца, восстановлением их повседневной и трудовой активности. В своей повседневной практике особый акцент делает на профилактической работе.